சீன குழுவால் உருவாக்கப்பட்டது, உலகின் முதல் மரபணு சுரங்க மாதிரி SYMPLEX அறிமுகப்படுத்தப்பட்டது
புதுப்பிக்கப்பட்டது: 16-0-0 0:0:0

IT之家 4 月 14 日消息,随着生物测序技术突破,全球天然基因库已积累数十亿量级序列,其中蕴藏海量高价值功能基因。然而,当前仅有少数明星基因被深度挖掘,绝大多数仍处于“沉睡”状态。

4 月 9 日,中国科学院深圳先进技术研究院定量合成生物学全国重点实验室、合成生物学研究所娄春波团队与北京大学定量生物学中心钱珑团队合作在国际学术期刊 Science Advances 上发表研究论文,செயற்கை உயிரியல் கூறு சுரங்கம் மற்றும் உயிரி உற்பத்தி பயன்பாடுகளுக்கான உலகின் முதல் பெரிய மொழி மாதிரி, "சிம்ப்ளெக்ஸ்"மற்றும் எம்.ஆர்.என்.ஏ கேப்பிங் நொதி மரபணுக்களை சுரங்கப்படுத்துவதற்கு SYMPLEX மாதிரியைப் பயன்படுத்தியது, உயிரி உற்பத்திக்கு அதிகாரம் அளிக்க பெரிய மொழி மாதிரிகளின் பெரும் திறனை நிரூபித்தது.

இந்த மாதிரி கள பெரிய மொழி மாதிரி பயிற்சி, செயற்கை உயிரியல் நிபுணர் அறிவு சீரமைப்பு மற்றும் பெரிய அளவிலான உயிர் தகவலியல் பகுப்பாய்வு ஆகியவற்றை ஒருங்கிணைக்கிறது.இது பாரிய இலக்கியத்திலிருந்து செயல்பாட்டு மரபணு கூறுகளின் தானியங்கி சுரங்கத்தை உணர்கிறது, மேலும் அவற்றின் பொறியியல் பயன்பாட்டு திறனை துல்லியமாக மதிப்பீடு செய்கிறது

எம்.ஆர்.என்.ஏ தடுப்பூசிகளின் உயிரியல் உற்பத்தியில் ஒரு முக்கிய நொதியான கேப்பிங் என்சைம்களை சுரங்கப்படுத்துவதற்கு ஆராய்ச்சி குழு சிம்ப்ளெக்ஸைப் பயன்படுத்தியது, மேலும் பலவிதமான உயர் செயல்திறன் கொண்ட நாவல் கேப்பிங் என்சைம்களை வெற்றிகரமாக பெற்றது. மூன்றாம் தரப்பு நிறுவனத்தின் சோதனை சரிபார்ப்பு, இந்த நொதிகள் சர்வதேச முன்னணி நிறுவனமான நியூ இங்கிலாந்து பயோலாப்ஸின் (NEB) வணிகமயமாக்கப்பட்ட மூடப்பட்ட நொதிகளை விட 2 மடங்கு அதிக செயல்திறன் கொண்டவை என்பதைக் காட்டுகிறது, வினையூக்கி செயல்திறனைப் பொறுத்தவரை, எம்.ஆர்.என்.ஏ தடுப்பூசிகளின் உற்பத்தித்திறன் மற்றும் செலவு-செயல்திறனை கணிசமாக மேம்படுத்துகிறது.

ஆராய்ச்சி குழு கட்டமைக்கப்பட்ட உயிரியல் அறிவுத் தளங்களுடன் பெரிய மொழி மாதிரிகளை (எல்.எல்.எம்) ஆக்கப்பூர்வமாக ஒருங்கிணைத்தது, SYMPLEX நுண்ணறிவு மரபணு சுரங்க தளத்தை உருவாக்கியது.

SYMPLEX என்பது ஒரு சக்திவாய்ந்த செயல்பாட்டு மரபணு தேடுபொறியாகும், இது பல்லாயிரக்கணக்கான உயிரியல் இலக்கியங்களின் வாசிப்பு மற்றும் புரிதலை தானியக்கமாக்குவதன் மூலம் முழுமையான சங்கிலி சான்றுகளுடன் உயர்தர வேட்பாளர் மரபணுக்களின் முழுமையான தொகுப்பை வழங்குகிறது, மரபணு, செயல்பாட்டு மற்றும் அறிவு மட்டங்களில் இலக்கிய உள்ளடக்கத்தை பிரித்தெடுத்து பகுப்பாய்வு செய்தல் மற்றும் நிபுணர் தரவுத்தளங்களுடன் மேம்பட்ட உயிரி தகவல் தொழில்நுட்பத்தின் அடிப்படையில் கருத்தியல் சீரமைப்பு, தொடர்பு மற்றும் புள்ளிவிவர மாதிரி உருவாக்கம் ஆகியவற்றை நிகழ்த்துகிறது.

சிம்ப்ளெக்ஸ் பெரிய மொழி மாதிரி பிரமைகளை திறம்பட தவிர்ப்பது மட்டுமல்லாமல், மரபணு செயல்பாடு தொடர்பான நுண்ணிய அறிவு மரங்களை தானாகவே உருவாக்குகிறது, இது விஞ்ஞானிகளுக்கு பரந்த அளவிலான உயிரியல் வழிமுறைகள் மற்றும் மூலக்கூறு செயல்முறைகளை ஆராய வழிகாட்டுகிறது.

▲ SYMPLEX பெரிய மாதிரியின் தொழில்நுட்ப பாதை மற்றும் பாரம்பரிய மரபணு சுரங்க செயல்முறையுடன் அதன் ஒப்பீடு

ஒப்பீட்டு முடிவுகள் SYMPLEX பெரிய மாதிரி மரபணுக்களின் ஆழம், அளவு மற்றும் பன்முகத்தன்மையை சுரங்கப்படுத்த முடியும் என்பதைக் காட்டுகின்றனஅவை அனைத்தும் பாரம்பரிய உயிர் தகவலியல் முறைகளை விட கணிசமாக சிறந்தவைஅதனால் தோண்டியெடுக்கப்பட்ட மரபணு பன்முகத்தன்மை தற்போதுள்ள புரத செயல்பாட்டு முன்கணிப்பு மாதிரிகளின் எல்லைகளுக்கு அப்பாற்பட்டது.

▲ SYMPLEX சுரங்க முடிவுகள் மற்றும் நுண்ணிய அறிவு மர உருவாக்கத்தின் பன்முகத்தன்மை ஒப்பீடு

SYMPLEX ஆன்லைன் ஊடாடும் தளம் இப்போது ஆராய்ச்சியாளர்கள் இலவசமாகப் பயன்படுத்தக் கிடைக்கிறது. இயங்குதளம் மட்டு மற்றும் மூன்று முக்கிய செயல்பாடுகளை வழங்குகிறது:

  • (1) PubEngine: உயர்-செயல்திறன் அறிவார்ந்த இலக்கிய மீட்டெடுப்பு, பகுப்பாய்வு மற்றும் காட்சி தொடர்பு ஆகியவற்றை ஆதரிக்கிறது.

  • (2) மரபணு செயல்பாடு குறிச்சொல் அமைப்பு GeneTagger: நுண்ணிய தானியங்கி தானியங்கி மரபணு மற்றும் செயல்பாட்டு பிரித்தெடுத்தல் மூலக்கூறு வழிமுறைகள் இருந்து உயிரியல் செயல்முறைகள் உணர.

  • (3) தரப்படுத்தப்பட்ட அறிவு மையம் GeneNorm: நிபுணர் அறிவுத் தளத்துடன் கருத்து சீரமைப்பு மற்றும் தரப்படுத்தலை உணரவும், அறிவு மரம் கட்டுமானம் மற்றும் செயல்பாட்டு முறை அங்கீகாரத்தை ஆதரிக்கவும்.

காகித இணைப்புடன் ஐடி வீடு: